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秸秆发酵多是利用单菌接种，有效降低发酵饲料的 PH 值，改善饲料中的乳酸含量，进而提高稳定性效果。单纯接种能够显著改善粗饲料的有氧稳定性，同时有效降低有氧条件下的损失，降低乳酸含量，所含有粗饲料的营养成分也会降低。而通过两种乳酸的有效混合进行发酵，能够在保证有氧稳定性的基础之上，提高营养价值。李日强等通过将真菌中的维生素进行有效分离实验中，发现羧纤维素酶的活力以及天然纤维素酶的活力比较大。

粗饲料是畜牧业发展***的部分。我国的草原面积虽然很大，但由于自然和人为等方面的因素，草原退化、沙化、盐化现象逐年加剧。而农作物秸秆资源丰富，富含粗纤维，可以作为粗饲料资源用于反刍动物日粮中，在反刍动物营养中具有非常重要的作用。然而，由于秸秆质地粗糙、适口性差、营养价值和消化利用率低等性质，有很多的限制性。单胃动物一般不能利用秸秆，反刍动物对秸秆的消化率也只有20%~30%。如何提高秸秆饲料利用是国内外学者长期以来研究的重要课题。

对于生物处理的研究有很多，惠文森等使用酵母菌发酵玉米秸秆，结果表明，酵母菌发酵玉米秸秆粗纤维作用甚微。陈合等首先利用黄孢原毛平革菌（Phanerochaete chrysosporium Burdsall）破坏玉米秸秆部分木质素的复杂结构，释放纤维素和半纤维素；再加外源纤维素酶和木聚糖酶降解纤维素和半纤维素，获得可发酵性糖类物质。酶菌复合降解秸秆也是秸秆生物利用的一种新型的方法。